La Sociedad Valenciana de Patología Digestiva fue fundada el 3 de marzo de 1960 como filial de la Sociedad Española de Patología Digestiva, siendo la primera sociedad regional en España.
Fueron 57 los socios fundadores, y el Dr. Francisco García Guijarro su primer presidente.
La Sociedad, que agrupa a las provincias de Alicante, Castellón y Valencia, estableció su sede en el Colegio Oficial de Médicos de Valencia.
La conferencia inaugural, "Carcinoma primario de duodeno", fue pronunciada por el Dr. Heliodoro Mogena.
El primer número del Boletín de la Sociedad Valenciana de Patología Digestiva se publicó los meses de octubre-diciembre de 1960. A partir de 1991 se denominó Revista de la Sociedad Valenciana de Patología Digestiva. El número 21(3), correspondiente a los meses de septiembre-diciembre de 2002, fue el último que se publicó.
El 15 de octubre de 1964, la Junta Directiva acuerda establecer el Premio Gimeno Márquez al mejor trabajo original publicado anualmente en el Boletín de la Sociedad. Posteriormente se instituyó el Premio con el nombre de Romero Calatayud y, más adelante, García Guijarro.
En febrero de 1965 se celebra el I Curso Monográfico para postgraduados sobre tratamientos actuales de enfermedades del Aparato Digestivo, impartido desde entonces cada año.
El 6 de junio de 1975, la Junta Directiva acuerda crear la Medalla de Oro de la Sociedad. Ha sido otorgada a los Dres. Francisco García Guijarro (1975), Miguel Carmena Villarta (1979), Francisco Javier García-Conde Gómez (1983), Benjamín Narbona Arnau (1990), José Zaragosí Moliner (1992), José Ferrando Cucarella (1995).
En diciembre de 1977, la Sociedad se integró en la Federación de Sociedades Científicas del Instituto Médico Valenciano.
En febrero de 1978 se celebró el I Cursillo de iniciación a la Patología Digestiva para pregraduados.
En marzo de 1979, la Sociedad inicia una nueva actividad organizando el I Curso intensivo de Patología Digestiva para médicos generales.
En mayo de 1982 se celebran las I Jornadas Internacionales de Avances en Patología Digestiva. Ediciones posteriores se celebraron los años 1985, 1989, 1994 y 1998.
Durante los días 23 y 24 de octubre de 1987 se celebró en Peñíscola la I Reunión Anual de la Sociedad Valenciana de Patología Digestiva. A partir de su XI edición en 1997 se denominó Congreso de la Sociedad Valenciana de Patología Digestiva.
En 2009 se creó la Beca de formación en patología digestiva "Dr. José Zaragosí Moliner", siendo concedida a la Dra. Marta Maia Boscá Watts. En 2010, coincidiendo con el 50º Aniversario de la SVPD, se creó una Beca de Investigación.
